La Facultad promueve la realización de proyectos de investigación y desarrollo en el marco de distintos programas financiados con recursos de la propia Universidad y en asociación con otros organismos del sistema científico-tecnológico.
Las actividades de investigación desarrolladas tienen una importante vinculación con las necesidades regionales, abordándose temáticas relacionadas con las ciencias básicas, la sanidad y producción animal, la salud pública y la biotecnología.
En este sentido, la UNL cuenta con herramientas propias para la promoción y financiamiento de la investigación, como lo es el Curso de Acción para la Investigación y el Desarrollo (CAI+D), que incluye proyectos de I+D tanto de perfil científico-tecnológico como encaminados a la indagación científico-social y orientados a problemas sociales y productivos. Además, se desarrollan en la UNL proyectos de investigación promovidos por otros organismos e instituciones del sistema científico-tecnológico argentino, tales como la Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT) y el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), de los cuales la UNL participa en su cofinanciación.
La Universidad a través de los distintos Programas con sus distintas convocatorias, ( CAI+D,CAI+Do, CATT) incentiva la investigación en las distintas Unidades Académicas alentando situaciones de trabajo en conjunto como así también promoviendo asociaciones de grupos de investigación a nivel nacional aportando cofinanciamiento como la Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT) y el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET)